美国启动儿童癌症基因组计划,数据共享是主要推动力-资讯-知识分子

美国启动儿童癌症基因组计划,数据共享是主要推动力

2019/03/09
导读
今年2月初,美国总统特朗普在华盛顿发表了任内的第二个国情咨文演讲承诺政府将为攻克儿童癌症再提供5亿美元的经费支持。

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10岁的脑癌幸存者Grace Eline,图片来自路透社


撰文 | 冯水寒

责编 | 叶水送

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今年2月初,美国总统特朗普在华盛顿发表了任内的第二个国情咨文演讲。演讲中,他特别提到一位10岁的脑癌幸存者Grace Eline。


特朗普承诺政府将为攻克儿童癌症再提供5亿美元的经费支持(未来10年内,每年5000万美元)。每年增加的5000万美元与美国国家癌症研究所(National Cancer Institute,NCI)以及NIH的其他研究所原本预计今年用于支持儿童癌症研究的4.62亿美元经费相比,增幅达11%。


与之相对的是特朗普政府计划下个月向国会发出预算要求,在10月1日开始的2020财年将非国防开支削减5%。


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► Science报道了各方对儿童癌症计划的看法,图片来自Science


近日,美国联邦政府官员表示该计划将于2020年开始,其重点是患者数据共享。对此,科研人员和患者权利倡导者反应不一。有人担心该计划将以牺牲NCI原本预算的其他项目为代价。对此,Science对各方看法进行了报道。


NCI表示,目前详情仍在制定中。NCI主任Ned Sharpless认为大数据将彻底改变癌症研究和治疗。2月14日,Sharpless同研究人员和倡导者的电话会议中表示“数据共享将是该计划的一个主要初衷”。NCI的发言人解释则说,“2020年新增的5000万美元将提供一个独特的机会,帮助利用现有数据,获得新的知识,推进儿童癌症治疗新方法的发现和开发。”


而对于该计划的细节,NCI并不希望像癌症登月计划(Cancer Moonshot)那样成立一个项目委员会,但NCI发言人表示“我们期待着与癌症社区合作,我们将在未来几个月继续与他们接触”。


来自加州大学圣克鲁兹分校(University of California, Santa Cruz)的Olena Morozova Vaske(从事基因组学研究,正与David Haussler合作开展儿童癌症基因组计划)认为这是个好消息。她们认为“由于儿童癌症非常罕见,因此将学术、行业临床试验与国际患者数据结合起来至关重要。这需要实行新标准,建立新的数字基础设施。而现有的数据库也需要互相连通,只有这样我们才能整合数据。同时,也必须确保从每一个病人身上获取信息。”


不过一些儿童肿瘤学家也提出了质疑,斯坦福大学学者Crystal Mackall说,“数据共享是最重要的,社区已经尽可能地做到了这一点。”来自费城儿童医院、NCI资助的儿童肿瘤研究组组长Peter Adamson认为“努力将儿童癌症基因数据整合在一起的效益可能不如整合成人癌症数据,因为儿童癌症的突变相对较少,这使得它们不太容易受到基因靶向或免疫治疗药物的影响。儿童肿瘤治疗的方法并不会通过全基因组测序揭示。”为此,他们还指出了其他的需求,如阐明如何靶向由两个基因产生的融合蛋白,这类融合蛋白常常驱动儿童肿瘤的生长,已成为癌症登月计划的一个重点,其投资可能会更大。Adamson认为“这是一个比数据共享更难的问题,但可能会带来更高的回报。”


此前,特朗普还签订了另一个法案——儿童癌症研究法案(STAR)授权国会每年将3000万美元投入儿童癌症研究,包括生物银行和幸存者研究。圣伯德里克基金会儿童癌症联盟联合主席Danielle Leach表示“我们很多人希望建立并利用现有资产,这意味着特朗普所要求的资金应该来自STAR的全额资助。”


另一个令他们担忧的问题是,特朗普政府在2020财年预算申请中将非国防开支削减5%,这是否意味着儿童癌症计划资金的增加将以牺牲其他项目为代价。


参考资料

https://www.sciencemag.org/news/2019/02/data-sharing-will-be-major-thrust-trump-s-500-million-childhood-cancer-plan


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